Alfa 159 Sportwagon je zaradi svoje popolne, vrhunske in inovativne varnostne opreme, namenjene brezskrbnemu potovanju v vseh razmerah, prvak v varnosti, saj je prestala najstrožje preskuse Euro NCAP. Pri tem je prejela pet zvezdic, kar je najboljši možen rezultat na preskusu EuroNCAP, ki ga opravljajo od leta 1997 na pobudo Evropske komisije. Alfa 159 Sportwagon se tako potrjuje kot vodilna na področju varnosti.
Vozilo ima šasijo, ki je bila zasnovana za premagovanje najstrožjih mednarodnih preskusov. Vsi glavni deli konstrukcije vozila so trdno povezani med seboj v vzdolžni in prečni smeri, uporabljeno je lasersko varjenje. Nosilna ploščad, sestavljajo jo jekleni nosilci, zaradi treh linij obremenitve spredaj ostane nespremenljiva tudi v primeru trka pri veliki hitrosti. Karoserija je izdelana iz visokoodpornih jekel "dual-phase", jekel, ki so bila za večjo trdnost podvržena dvojni toplotni obdelavi. V vratih so prečke iz visokoodpornega jekla, za sredinski nosilec pa so značilne tri ravni ojačitve za zaščito v primeru stranskega trka.
Ob prednjih, stranskih in okenskih varnostnih blazinah je vozilo opremljeno tudi z inovativnimi varnostnimi blazinami za zaščito voznikovih kolen, ob doplačilu tudi za sovoznika. Za najmanjše potnike so na voljo tudi trojni priključki za namestitev otroških sedežev Isofix.